Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Csmd1Q923L3 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms