Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms