Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms