Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms