Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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