Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gli3Q61602 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gli3Q61602 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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