Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms