Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Spg11Q3UHA3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Spg11Q3UHA3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Spg11Q3UHA3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Spg11Q3UHA3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Spg11Q3UHA3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spg11Q3UHA3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spg11Q3UHA3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Spg11Q3UHA3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spg11Q3UHA3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spg11Q3UHA3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Spg11Q3UHA3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Spg11Q3UHA3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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