Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Puf60Q3UEB3 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Puf60Q3UEB3 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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