Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Q3U6N9 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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