Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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