Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms