Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms