Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms