Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ElocP83940 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ElocP83940 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ElocP83940 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ElocP83940 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ElocP83940 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ElocP83940 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ElocP83940 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ElocP83940 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ElocP83940 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms