Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms