Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 A3galt2-201ENSMUST00000030585 3390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 AL662807.2-201ENSMUST00000224024 3335 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ubox5-201ENSMUST00000028761 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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