Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Otx1P80205 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms