Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms