Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nphp4P59240 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms