Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp1P55194 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp1P55194 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp1P55194 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp1P55194 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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