Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VdrP48281 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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