Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnr1P47746 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnr1P47746 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnr1P47746 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnr1P47746 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnr1P47746 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnr1P47746 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnr1P47746 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms