Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms