Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms