Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa-rs1P17533 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Defa-rs1P17533 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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