Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Irf1P15314 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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