Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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