Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-Eb1P04230 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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