Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms