Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms