Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms