Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt4B2RU40 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms