Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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