Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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