Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp4Q9D4F8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Tubgcp4Q9D4F8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tubgcp4Q9D4F8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms