Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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