Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms