Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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