Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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