Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rnf144aQ925F3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rnf144aQ925F3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rnf144aQ925F3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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