Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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