Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssuh2Q8C3L1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms