Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.6 ms