Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SnupnQ80W37 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms