Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pnma8aQ80VM8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pnma8aQ80VM8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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