Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms