Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Dsg1bQ7TSF1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Dsg1bQ7TSF1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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