Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssx9Q6XAS3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssx9Q6XAS3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssx9Q6XAS3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssx9Q6XAS3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssx9Q6XAS3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms