Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rad54bQ6PFE3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms